PyPI - SigProfilerAssignment - Versions diffs - 1.1.0__tar.gz → 1.1.1__tar.gz - Mend

SigProfilerAssignment 1.1.0tar.gz → 1.1.1tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.

Files changed (272) hide show

{sigprofilerassignment-1.1.0/SigProfilerAssignment.egg-info → sigprofilerassignment-1.1.1}/PKG-INFO RENAMED Viewed

@@ -1,6 +1,6 @@
 Metadata-Version: 2.4
 Name: SigProfilerAssignment
-Version: 1.1.0
+Version: 1.1.1
 Summary: Mutational signatures attribution and decomposition tool
 Home-page: https://github.com/AlexandrovLab/SigProfilerAssignment.git
 Author: Raviteja Vangara

sigprofilerassignment-1.1.1/SigProfilerAssignment/data/Reference_Signatures/GRCh37/COSMIC_v3.5_DBS_GRCh37_exome.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,79 @@
+Type	DBS1	DBS2	DBS3	DBS4	DBS5	DBS6	DBS7	DBS8	DBS9	DBS10	DBS11	DBS12	DBS13	DBS14	DBS15	DBS16	DBS17	DBS18	DBS19	DBS20	DBS21	DBS22
+AC>CA	3.57012030208745e-05	0.0002610398876459	0.0056764400425715	0.003393749142932	0.0019496339514559	0.002302652036663	0.0599036576296039	0.201009173622895	0.0208425531795331	0.005820641174185	0.0010812806646533	0.0026201550745396	0.0019297230777191	0.0270318711728125	0.0133646618773862	0.0552697537503594	0.0180269368309129	0.0086575497074799	0.0046640642289266	0.0057077924687131	0.016515194059669072	0.005961575648493564
+AC>CG	1.89640193108871e-05	2.21209007679599e-05	4.15851630647405e-05	4.0641180390687e-05	0.0004209026729711	0.0001263858696369	0.0081568165669431	0.0009096833499243	0.0017538250081814	1.06979115009325e-05	0.0001531157898266	0.00124998580322	4.61137627551001e-05	0.0006386220106099	1.06071866027191e-05	0.0041778740420252	0.0015532038407996	0.0022714022972532	0.0005713438907881	0.0021659511016226	4.521404067155485e-05	0.0007788506501480426
+AC>CT	0.0030824368404838	8.79441880468038e-05	0.0026996613880201	6.8172302590829796e-18	0.0018403087001802	0.000207758494964	0.0177492316484649	0.297306591614495	0.0241468605149528	0.008159777601176	0.0005966769684974	0.0002413847462606	0.0025549692896675	0.0020006374131486	0.0130538023200949	0.0135475365912247	0.0126085774411785	0.0169058607392412	0.0151024370295433	0.002691266681136	3.2127456659086825e-08	0.0007753861717656895
+AC>GA	9.12514129204776e-05	0.0001654182816102	0.0052294764498196	0.0036068834558289	0.0005083628739916	0.0074273506164536	0.0126985309137757	0.0010845150447868	0.021435633809472	0.0032336897426811	0.0003488511376004	0.0037751751568085	0.0024733980727116	0.0010694837631019	0.0140191278778926	0.008285851059252	0.0167020687101625	0.0061556741005822	0.0031308935999924	0.0017992376256337	0.0035800963599247858	0.0035326988177177988
+AC>GG	4.10168751004414e-05	2.9099102902963002e-18	0.0004022671440462	5.74384424473218e-18	1.01134285287096e-17	9.00282195655623e-05	0.0033149306601702	0.0007572903875725	0.0060409517700758	0.0003566127644773	0.0017758257016924	0.0039075702727124	0.0013111655999023	0.0003602804045316	0.0015016128392106	0.0034406035322156	0.007018314210555	0.0041824340936984	0.0007242981685151	0.0029893773731469	0.000975989296694151	0.0004340840428794598
+AC>GT	0.0021268097373775	0.0001954308311726	0.0090286683296677	9.177040733380941e-09	0.0007488784267981	0.0001142666529465	0.0058729074059367	0.0001411735960965	0.0102518253444441	0.0173470829535971	0.0045066504346589	0.0010406558550959	0.0039751308118784	0.0043613342107201	0.0800732291012082	0.0034967631739727	0.0265802522855044	0.0102491343674815	0.0110626866710459	0.0003589535447435	0.012999224103235847	0.0010143413250233292
+AC>TA	0.0008622199696573	0.0010329923337072	0.0009028666541058	0.0010410779146974	0.0013483450694397	0.008743152398456	0.0070735910343861	0.0115930873107727	0.0349070404429044	6.3465208878837e-05	0.0002083635111117	0.0037104633735237	0.0023100873011805	0.0021640960210148	0.002200199561747	0.0055596315215102	0.0075388505179067	0.0192366549612985	0.0057923130865411	0.0105860777841074	0.003089783180122125	0.005191453525153423
+AC>TG	0.0001235850658455	4.43813655786198e-06	9.926780860615469e-18	4.35090056198686e-05	0.0010203693156127	0.0003886804069717	0.0013024803837584	0.0024027606514997	0.0151659233243579	4.62971763260694e-06	0.0001886323512191	0.000832542718593	0.0038363839015834	0.0001048150576782	0.0003190055316529	0.001067124098224	0.0076627005824775	0.0116384555402333	0.0009450116828566	0.0001481647691008	0.0002224451553313699	0.000854922270883538
+AC>TT	0.0190406921339623	0.0020380662763128	1.59186215602662e-06	0.0001319789558042	0.0068054982585896	0.0027527939999637	0.0015400065813647	0.0002505605465679	0.0376182671483852	0.0004291440000518	0.0022257013566869	0.0017428950470967	0.0140935648557902	0.0010344486859959	0.0059877620114723	0.0040884510485608	0.0152019549063175	0.0141256643206939	0.0620920825517467	0.0028484279787128	0.0027202585282053967	0.003958225721412536
+AT>CA	0.0002265783038022	1.72571611313212e-05	0.0041172666151388	0.0004912572120512	6.43720000027892e-05	6.45630060613167e-05	0.0094775837381807	1.70102491022224e-05	0.0070396901221087	0.0013958966724384	0.0048950834866316	0.0006609630142807	0.0024651590259799	0.0020757565555126	0.000652828716068	0.0050293561081604	0.0057791249324049	0.0025021938637905	0.0026277613171509	0.0016611745459518	0.004547929992308747	0.0031831990715115717
+AT>CC	0.0001396137006124	1.90376618829655e-18	0.0053103382177114	3.75246530689693e-18	1.26966469433509e-05	3.6181646735057e-05	0.0053450155629604	8.74675575148771e-05	0.0009866652436843	0.0004587081451886	0.0009810818610368	0.0011839391888327	0.0005905142297203	0.0003284441492765	0.0056495305719964	0.0013368619964733	0.0040144803591878	0.0009979515811995	0.001245088668241	0.0009162475001097	0.0003178514207590001	0.0006108619323946185
+AT>CG	1.87043897331826e-06	1.90376618829655e-18	0.0085386496473245	5.071188829035e-18	6.25891046503214e-18	1.03052577555248e-06	0.0009477588009211	0.0001627018089038	5.1124045450898795e-18	0.0010241847087202	8.98525919249257e-06	0.000460219006482	1.36493905953932e-06	3.87667710765622e-08	1.69258450727959e-07	0.0023340101042408	0.0008064971746537	0.0004075757566663	0.0001811101401086	0.0011530396521115	2.903047277076701e-07	9.083652135535886e-05
+AT>GA	0.0009965675351862	7.67149293085369e-05	0.0010585586507172	0.0001737632667005	0.0006616014091831	0.0009174782304202	0.0122952442070971	9.9088984176694e-05	0.0035309309942507	3.18709335823517e-05	0.0057832205872352	0.0021765574892361	0.0012499326920849	0.0037291504708133	0.0044232316570685	0.0030389147766024	0.0080918809486142	0.0014488187264227	0.0061959640559986	0.0062783209087201	0.008668805602119129	0.0017205903459166915
+AT>GC	8.179363835985e-05	2.67075112746638e-06	0.0030704049972289	9.43476991448372e-06	6.25891046503214e-18	9.73903480192457e-06	0.0079321403151083	0.0001382358085314	0.0010032944207241	0.0016133877192461	0.0021583806106752	0.0013697051394089	0.0001759183839659	0.0004190306495445	0.0082886670120096	0.0009658326111736	0.0062221537264669	0.0002713762493913	0.0014223504329376	0.0002735174621012	0.00243512444013318	1.1571961958743654e-05
+AT>TA	0.0010999849519482	0.000209138987904	0.0013743715154856	0.0024294704071066	0.0004726574200647	0.0012459577551546	0.029030437545106	0.0001926735006942	0.0050996179888198	0.0011586337841793	0.0019828184575438	0.0009146250607246	0.0061611439404542	0.0082369834347202	0.0069621682226405	0.0041843473787168	0.0071385503552976	0.0043896060048361	0.0074667347025229	0.0021757890670591	0.06685696106253063	0.004738850550189487
+CC>AA	1.09781529842081e-05	0.728569478268195	0.01171556315839	8.269507167704139e-18	1.37930935317301e-17	1.0356869535100601e-17	1.70174335555977e-17	0.0513569647448713	1.10220853842337e-17	0.0119388386390943	8.364339316204419e-18	0.0122476606897869	6.62273912545598e-07	0.0051750564611802	0.0211722065255412	0.0481796401264367	0.00044215195015	0.0128298725433039	0.0275860145091261	0.0006198578343239	0.003817739001952574	3.974182606889092e-08
+CC>AG	1.27388001609207e-05	0.0730582099818961	1.4312166697570302e-17	0.0064176526342991	0.0319185044741918	0.0768819374912593	0.0001562441355215	0.0208932537065816	0.0322490332853764	6.21315539287875e-05	0.0011060660910144	0.0147536953804966	0.0150781360479239	0.0002148106618803	1.11155144522508e-05	0.0150663342961639	0.001522748946919	0.0575977074589145	0.0084260933965764	0.0065015229006992	0.0016855300354206933	0.01644055095184539
+CC>AT	0.0193720425418847	0.100631142934732	0.007591272498989	0.0185556447059206	0.0031918505787819	0.0005466605303747	0.0016031608358835	0.0388210117118635	0.0238203089544168	0.009150204573763	0.0392585079568681	0.0111418771245961	0.0558755129528412	0.0009392421660354	0.0363222076060426	0.0259181256774818	0.0009171578553629	0.119990416150873	0.113133512434629	0.0090613970506717	0.0017450663667909264	0.026171337064813283
+CC>GA	0.0001388156374608	0.0178117120931974	0.0008184135308362	0.0041957033957525	8.88012497852339e-05	0.0443069611427783	0.0005682561559728	0.0010904925610361	0.0134370976095604	0.0029542089923845	0.001084445127386	0.0094131903786548	1.34262157709049e-05	0.0	1.11030809908949e-05	0.0041971297019582	0.0009397029158796	0.019322340585148	0.0051699513611538	0.0013931262298712	0.0009224828616998247	0.008564966268874648
+CC>GG	0.0001017032663253	0.0004528398992274	9.34803680697159e-05	8.62391461774861e-05	1.56321726692941e-05	0.022590310243791	0.0038573721598906	7.5512151937929e-05	0.0037379557419993	6.4571502750675396e-18	0.0039258510232878	0.0161568776726987	0.0009933282459521	0.0035188429743344	7.3481756613873e-07	0.0002471264119387	0.0041401416377399	0.0063039378721672	0.0014328113936999	0.0043925243366233	0.002383374061997112	0.0006221450398331016
+CC>GT	0.0071686914360206	0.0011069427584102	1.46989820137208e-17	9.43905175285087e-05	3.25779732939911e-05	0.0042934065747545	0.0003067072380287	0.0003086815412406	0.02186582194052	0.0009411640732976	0.0790859798961261	0.0055268033213113	0.0302793827485733	0.0008202565426313	0.0006460948725946	0.0038262251670086	0.0118705728701574	0.0230000869904539	0.0161678904983783	0.0068003128273298	0.0037685454785137957	0.010740122516914863
+CC>TA	0.0107737563464391	0.0161009824671177	0.026807889930798	0.0002009206715792	0.0016681682587983	0.0027707446069665	1.70174335555977e-17	0.0009651329498002	0.0008392083839801	0.0208276087964641	0.0669101522661906	0.0080812788477086	0.0533912318471404	0.0	0.0641863454858715	0.0099604972916544	0.0003648465336599	0.0274127824370992	0.0486037618310874	0.0162660176136154	0.0005465174476731264	0.006080519259453303
+CC>TG	0.0026416418823456	0.0002384956467231	3.73921472278863e-05	9.80527278456348e-06	0.0063180250143056	0.0085743324978115	0.0004440684226657	0.0056748771065576	0.0189340914196747	6.4571502750675396e-18	0.0367550668895549	0.0215922798496856	0.012322072187516	0.0009225251776232	3.53110302509982e-05	0.0005907174571687	0.0396991664391373	0.0218481684396991	0.0075073955191144	0.003261172562645	0.005954293686102729	0.003526272356179653
+CC>TT	0.888834893402849	4.19543069747121e-18	1.4312166697570302e-17	8.269507167704139e-18	1.37930935317301e-17	1.0356869535100601e-17	1.70174335555977e-17	0.0059040295190636	1.10220853842337e-17	0.0179518302161386	0.377792018302555	0.0010561113854568	0.0001287109338806	0.0105338453518952	0.107808071645631	0.0228474966847492	0.0010323135777049	0.0387439420053573	0.10431068316541	0.0095849786760862	0.0074575730160486384	7.286001445963338e-08
+CG>AT	1.21229520170265e-06	0.0022464551704636	0.000710534000303	0.0006653373234721	0.0041816518761095	0.0182676467376146	0.0002269263324047	0.0008425555986794	0.0005193070519851	1.2534544442915701e-17	0.0040202564922476	0.0435852419108141	0.0010344656151059	2.44396320524333e-08	0.0004474708557671	0.0003555344717066	0.0061159286179783	0.0019402918270438	0.0006606226032145	0.0046360593238775	0.0003883189419870955	0.0001664904450986499
+CG>GC	1.08965837366971e-05	0.0007208191498704	2.77826102697039e-17	1.16955170086106e-05	0.0002529599199141	0.0014294321943021	0.0006830409521217	2.95784167844457e-17	2.84646691537459e-05	3.21398575459377e-05	0.00036668341958	0.124493918671675	0.0029338031157448	0.0045915806919552	6.66145029567412e-06	0.0005152583898866	0.005688182692543	7.55816714441241e-05	0.0001180756043523	0.0004792912505577	9.929510235253883e-05	0.0001089567530794098
+CG>GT	3.4177476664917e-06	0.0025004033126432	2.77826102697039e-17	1.60526704039753e-17	0.0165226203190197	0.007801302776011	7.56421108015838e-05	0.0031661208486692	0.0002357823428235	1.72540287878192e-05	0.0026065407974679	0.139673903785093	0.0059232002158389	0.0006066151963797	0.0005506967860916	0.0039719701336543	0.011597027791691	0.0037856488496915	0.0002387519929415	0.0007693108784208	9.35465501762046e-05	0.00018403021914778305
+CG>TA	0.0007158995201815	8.144120903872829e-18	0.244934322960432	1.60526704039753e-17	2.67749915231694e-17	2.01046337698623e-17	3.30340425916095e-17	0.00132401369716	2.1395942980565602e-17	0.605608825446073	1.63030299387362e-17	0.0442478182583321	0.0016428919537387	2.37944864858318e-07	0.0002099804984505	0.0048154716394582	0.0142440316290742	0.0005979026607743	0.0049285979625271	0.0016231446656846	1.2197112551319477e-07	0.0003798290608833594
+CG>TC	2.5331541528115e-05	0.0041998958077548	0.0018063602433517	1.60526704039753e-17	7.59899759419475e-05	0.0215868345721977	0.0001779599418375	0.0023680480477627	0.0003153790460004	0.0044828588726501	0.0015131177866703	0.173430183156553	0.0055490234306255	0.0007524788140143	0.0014897778465417	0.0033004293377751	0.0137299312844177	0.0028336671835134	0.0007721858438379	0.0040536704455913	0.001259176868874084	8.899212547510681e-06
+CG>TT	0.0002493588697472	0.0108611265841335	0.0179385005932921	0.0008282306497772	0.0056605264579051	0.0453057025773185	0.0001143767182651	0.0008608706590547	0.0001966434227371	0.0131440802244173	0.001544042734653	0.159829464934406	0.0041177489859202	0.0004039066643795	0.0064517521847904	0.0097717799155839	0.0300121868500621	0.0059748719630706	0.0042307451329622	0.0012417437712362	0.002114008850487084	0.0011574310989585232
+CT>AA	2.14238528325638e-05	0.0024123025621232	9.91362942135523e-05	6.17552695980433e-18	0.457105625082873	0.004175571947385	1.2708329236317601e-17	0.0207365249855437	8.23110544113571e-18	0.002557575223271	0.0037390542120459	0.0044969479164095	0.0594741846655798	0.0003114873325483	0.003479429451046	0.0644252895981753	0.009756339258062	0.0239627328799663	0.0101540398123644	0.0117348309888007	0.0014756119795510264	0.0230501446348721
+CT>AC	0.0003241475339024	3.13307611382326e-18	0.0280082952756321	6.17552695980433e-18	0.205010892056303	0.0018174929132493	1.4198465186593702e-17	0.0140927841271828	8.23110544113571e-18	0.0084601729231495	0.0019969950563979	0.0044308337333748	0.0249667610839038	0.0131037378584242	0.0709672764284151	0.087406561361424	0.0136795464262252	0.023611229615227	0.0066830166166295	0.0069605777048262	0.012788407355437762	0.012657012143395747
+CT>AG	2.20425922645512e-18	0.0004411281007799	0.109723218883517	0.000320388985329	0.0261903866439418	0.0368158723642334	0.0017705275219387	0.0205351993829285	0.0005309209015837	0.0172457379885896	0.0004214932293864	0.0023609680589122	0.0128110710978731	0.0	2.72981850424994e-06	0.0348952728954901	0.007615593128833	0.0065620922934952	0.0026478303493027	0.000696608666533	0.0007415738369353595	0.00485920445345113
+CT>GA	6.89894466665952e-05	1.35992032758276e-05	1.65617127584632e-05	0.0005939992361557	0.0157927053048026	0.0068412277231655	0.0026276874594647	0.0056069143573373	0.0025907495629915	4.82208973261684e-18	0.0098575064817718	0.0011017961049129	0.0010547912899178	0.0002953958545522	0.0002617719528733	0.0011738610685613	0.0051725260049938	0.0032935657788051	0.0031781384138213	0.0038220337360324	0.0015838051255078896	0.0034621551816047306
+CT>GC	0.0001949524202305	0.0001007002219145	2.59017484420152e-05	6.36961494996961e-05	0.0047574302153486	0.0016683647113748	0.0219208107795963	0.0002385709750421	0.0028370539865749	4.82208973261684e-18	0.0051921862967916	0.0004964575933991	0.0037410192413338	0.0064212326112266	0.000308753614947	0.0093323457828228	0.0103957885047983	0.0011057559003808	0.0033661654231393	0.0007741494232559	0.0016817949018339503	0.0031340467026905157
+CT>GG	8.35298233182991e-06	6.74700803408463e-05	5.76771275716249e-05	0.0008173001154953	0.0005591210204741	0.006347243291758	0.0056207211092214	0.0003080277994166	0.0094872533474601	4.82208973261684e-18	0.0034161359709913	0.0063643330814391	0.0025548079368499	0.0001382564839626	0.0002249305451823	0.0043276833899553	0.0072611291814607	0.0017927071045333	0.0010102813565736	0.0006145972234584	0.0018971023259579502	0.0029194328447490515
+CT>TA	0.0060419789519926	0.0025400569338474	0.0001770967054629	6.17552695980433e-18	0.0032762504500197	8.2375311936176e-05	1.2708329236317601e-17	0.0109722387971248	8.23110544113571e-18	0.0026226539120309	0.0354360366641343	0.0059112135919678	0.0299693048733457	0.0020282445188581	0.0031775533074123	0.018724329916455	0.0008547141484906	0.00859835272343	0.0714341009441549	0.0220932280408392	0.00862580115463244	0.009509678593083966
+CT>TC	0.0081230193142646	2.88513483862862e-05	0.0061021505482821	6.17552695980433e-18	0.0002324761856363	7.73433358676765e-18	0.0888073848098099	0.0179179685629013	2.73761821767263e-05	0.0017896519019398	0.0025408571782071	0.0050684785778269	0.0082053026461372	0.0402793432896723	0.0617626896223558	0.0978508102946109	0.0175530599961136	0.0057076988553786	0.0457911427613102	0.0008061160521696	0.04319540418576844	0.0027631132202944934
+CT>TG	0.0017329104879857	0.0002930838680356	0.0502416840408449	2.71723186231391e-05	0.0008573179824651	0.0104389312662338	1.2708329236317601e-17	0.0009724025901426	8.6326227797277e-18	0.0297407629339204	0.0012576817940661	0.001773095355679	0.0037729275149193	0.0005427070675437	6.70384000023285e-06	0.0068195039151072	0.0229013248430508	0.0023442147534761	0.0135354673532417	0.0073350526542362	0.0004991992515576075	0.0032205907732594115
+GC>AA	0.0017125468739212	0.0053486919429771	2.9139872135678e-05	0.40560352934767	0.0001827845929746	1.08362742781993e-17	1.78051463228842e-17	0.0181934708469182	1.15322820217535e-17	0.0037200876506596	0.001190601029915	0.0207591732345325	4.30886065541349e-08	0.0004266006906996	0.0569939348330894	0.0230864620625763	0.165321982590901	0.0440717448670884	0.0184909805165973	0.0174274925719578	0.017613616390965894	3.6699463140747044e-07
+GC>AG	0.0001159760328544	0.0003421901745618	0.0007039167816182	0.013973536292686	0.0036556904850591	0.0047794301606647	0.0001437804957489	0.0120161536193178	0.158484187123567	6.75604256663082e-18	0.0039170770550293	0.0080579691789988	0.0229209153687312	0.000975949895963	0.0051048389951152	0.0111366540242927	0.0248174671621201	0.0535117522136689	0.005556913352899	0.0166252078068584	0.0041580057754755885	0.027053519466250203
+GC>AT	5.27720369627247e-05	0.0010034065345285	0.0053805128035381	0.0114261485887207	0.0021576812081339	0.0024550075495841	0.0006890611322914	0.007771009998449	0.161040383916911	0.007066342769459	0.0323843427746872	0.0054445721638156	0.0234655769674157	5.05230513201642e-07	0.188654142123839	0.0059939489995299	0.0607185437993717	0.0641313186224693	0.0055024447498134	0.0288045199920725	0.006083383652153375	0.011558818155366747
+GC>CA	6.24162079887668e-05	0.0011160653142397	0.0003195942457843	0.01471549372036	0.0062943837076297	0.0113478835095278	0.0013190580247675	0.00681197461463	0.0350198928725036	9.57379554263251e-05	0.002512167553966	0.0041176119890808	0.0140466263945646	0.0003197454598913	0.0015498726865401	0.005546074937275	0.0148996403246322	0.0296309917004691	0.0014621096729741	0.0170599876540682	0.003496042244887254	0.0055160904296484995
+GC>CG	5.58061581844009e-06	7.04235798497697e-05	1.49746565141679e-17	1.21502884773915e-06	0.0004439050473858	1.18023999367375e-17	0.0052171698288507	0.0003413039432286	0.0031952463113108	6.75604256663082e-18	0.0048100278274656	0.0007914386365606	0.0011682131680836	0.001170840009596	0.0004574675878223	0.0018502575925818	0.0004853866649279	0.0024484711068521	0.0002582240178397	0.0016813769285172	1.0488714008682665e-05	0.00016913081854736872
+GC>TA	8.96149375116495e-07	0.0007749288617023	0.0057041529047176	0.0218877509146112	0.0003050995910766	0.0010825542449938	1.22902779927873e-05	0.0120725663865408	0.0178933762748843	0.0025621192779252	0.0002893154835047	0.0006020798404698	4.57900865888769e-05	1.29682649947304e-05	0.0022121186662575	0.0009832170186431	0.0114938651162119	0.0240693954306196	0.0012833737050973	0.0005376346742805	0.0022746532277149916	0.00021139785877920245
+TA>AT	0.0002027936359623	0.0010727402082681	0.0007244306789414	0.0139277011848846	0.000952154058964	0.0041462347229188	0.040700643254256	0.0050684547295919	0.0073396260866361	0.003513211727866	0.0009836691002773	0.0023740172952317	0.0031256793818409	0.0079295976012406	0.0122023795413111	0.0045945135473038	0.0042619370633285	0.0048982449873781	0.0051154421767191	0.102051022829256	0.12942841700750274	0.007229266124501419
+TA>CG	3.0310969724823e-06	7.37109089504227e-06	0.0016686883019454	0.0001782198147557	4.01771245367342e-06	0.0001253064811857	0.0022246768762899	1.09245755370617e-05	0.0006392577482927	0.0013883941718697	0.0002576065309375	0.0001581380437043	0.0001224635346204	0.0001111960905209	0.0073891096574038	0.0006832956034245	0.003544092015605	0.0009026537779048	0.0003039459917562	0.0040852979363219	0.0016081794326481135	6.312307660208492e-05
+TA>CT	0.0002819032595951	0.0001092243568769	0.0001718649107364	0.0039950510196832	0.0011558235642819	0.0126273899305739	0.0212256042189089	0.0021423364435799	0.0067240443758053	0.0005472502032809	0.0014909425732356	0.000914539772869	0.0081995850371683	0.002482758693903	0.0012358380276881	0.0059327228776121	0.0082302520948084	0.0052225871552971	0.0048428258867181	0.0741266588961567	0.015328039866466898	0.012236048565553595
+TA>GC	8.06954293336347e-06	3.20583953212949e-05	0.0009942184284231	3.2147571133428e-05	2.65810633817177e-05	0.0001277254860047	0.0011013970454494	0.0004122689135414	0.000274170342222	2.50305481017001e-18	0.0004499291545638	0.0005210532541071	6.34414485985977e-05	6.19903237553057e-05	3.84131423940069e-05	0.0004917259946855	0.0003411074179174	0.0001229970035446	0.0001318492040413	0.0018175048967856	0.0014290842659490626	0.0012121104313564575
+TA>GG	2.82233267768881e-05	3.0771379450732e-05	0.0027278555774863	0.0010170887022373	0.0008299524576164	0.0001054702547059	0.0031437232145579	0.0001133871626423	0.0015389538033951	0.002901777591869	0.0001654150135827	0.0007472003014638	0.0002969845681289	0.0002715320167786	0.0011199243221346	0.0005102597375594	0.0028609462368235	0.001754902713005	0.0005968172112786	0.0062168892270597	0.004775748451571858	0.004445010463679445
+TA>GT	0.0004618074965126	0.0005071135033624	0.0001808576357919	0.0036926733469038	0.0009725211622605	3.02315139356246e-05	0.0191832780498004	7.99459392388246e-05	0.0036840185236907	0.0012194896546915	0.0011777562730572	0.0004466635821223	0.0030763727872768	0.0027024151161582	0.0003965749686116	0.0031925642245546	0.0060233317024853	0.0032956784728373	0.0040082615062882	0.0356215856536178	0.02131384488871164	0.012044329792666123
+TC>AA	8.4259636573345e-06	0.0010891058984259	0.0052813059966242	0.334337644540478	0.039608398779396	0.0426656880959939	0.0275272829340648	0.0390369400456391	0.0033644093735882	0.0049173712034926	0.0001843077877496	0.012375760115212	0.065628745126743	0.0009237978454918	0.0004518370819659	0.0762366597928219	0.0544665190127181	0.0033167935246816	0.0130391131642696	0.219984271671672	0.04319761251257108	0.2617441041404441
+TC>AG	2.38864474322602e-06	0.0001502212442833	5.9090878777089e-06	0.0016496342810373	0.0146080486301574	0.0077133602564326	5.62024560714236e-06	0.0116708373201906	0.0425793784925726	0.0001762710036655	0.0402589739224488	0.0043377621542402	0.0647689547651728	8.36113869043879e-09	0.000106740081691	0.0103118364939993	0.0002178151588296	0.0106955236640984	0.0028193691180777	0.0097615162122884	0.013949339039481897	0.06733877608354392
+TC>AT	0.0019021226444338	3.1314553376878097e-18	0.0010774249728918	0.0074189432514856	0.0007333438449239	0.0005533493100663	0.0032161981942398	0.0186129739804572	0.0472293750543027	0.0020098778712422	0.0718546247726761	0.0106396103678879	0.152161986134319	0.0029080200875862	0.0075768335858816	0.0266854580774982	0.0012287254138172	0.0663946659435663	0.08989179599466	0.0292491679080818	0.08370454453651022	0.22920843061002547
+TC>CA	3.41676691425858e-06	0.0005122550287462	0.0630101140333129	0.0746305135525626	0.0014019804185957	0.0109924695212241	0.0038060682618146	0.0177074779380948	0.0444940832810735	0.0163912364777518	0.0002395156084403	0.0132340124170522	0.0361421262589454	0.0069300998902467	0.0190280468609203	0.0147326392375746	0.0050093328341041	0.0169741728394888	0.0045283440420096	0.018459864721108	0.019637173510721136	0.036117582259839964
+TC>CG	2.55097982286274e-05	2.92118975146417e-06	0.0001115903336332	0.000352862537584	1.03931672895262e-17	0.0008030092470121	0.0022892581115608	0.0109665627324048	0.0071026414028637	0.0005476751245057	0.00275187916348	0.0038102711417608	0.0069637360153489	0.0011075050492807	3.1552998465414e-06	0.0002721567733867	0.0015374326075202	0.0019786002393773	0.000635184263617	0.0005776044373622	0.002274855950452303	0.0032284424348480866
+TC>CT	0.0014691193293011	0.0025162099719636	0.0186625375092653	7.30098733615721e-06	0.0010294265517404	0.0087473974762686	0.0129069249481533	0.0088134944768391	0.0468646694237343	0.0170416828033379	0.0170718438237592	0.0034717830748726	0.031318101660662	0.0435512774144084	0.0445681509578608	0.0079392524860594	0.0193920842368108	0.0230263315987174	0.0181954863655453	0.0222524151394028	0.05604140255594723	0.016380681312725135
+TC>GA	4.96281529175115e-05	0.0006647298695448	0.0748425476286181	0.0321105279541436	2.41199920115419e-05	0.0068376886777583	1.2701755072141701e-17	0.0096686854071735	0.0157735169259648	0.0284895300684734	0.0001995961987997	0.0069692382356291	0.0111624865640491	0.0	2.18086901158009e-06	0.0042196054755276	0.0058290956000989	0.0017155383223059	0.0032040907289121	0.0085974926770458	0.004655195356794949	0.017646841390470337
+TC>GG	0.0003177933360903	7.41186191438339e-06	0.0001702712333491	9.17032225797524e-06	3.41209643090105e-05	0.0014066634631597	0.0009915434008716	0.0019216639350651	0.0034008792981979	4.81959521040363e-18	0.0062257019163118	0.0009507031531296	0.0148241561281835	0.0001381849623009	1.0672337716243e-09	0.0023549848220073	0.0002654779409548	0.0016595064254875	0.0012003165055856	0.0011692976811482	0.00043531263468131486	0.0033649269260284517
+TC>GT	0.0039434259749788	6.4356288354879e-05	0.0417502128875966	6.1723322890218004e-18	3.78468167335576e-05	7.7303325274746e-18	1.2701755072141701e-17	0.0002776855871864	8.3454161501217e-18	0.0298554664416194	0.0129100510677065	0.0007625874903277	0.0320986757134773	0.0007644327910283	0.0001370652973043	0.0044860757269401	0.0003639024804286	0.0073306197663388	0.0258977686967196	0.0066359865383296	0.00444313082937329	0.01240897735021423
+TG>AA	0.0010289463013259	0.0021595460641226	6.24449462982701e-05	0.0065379161130195	0.0171414356924387	0.0230739645950467	0.0308307778459324	0.0084533507372471	0.0139929176771203	0.000897156935258	0.0064597375380388	0.0015219839581594	0.0180087520404525	0.0005843129256221	0.0032071314980325	0.0073258095566891	0.0074998253444911	0.0088085477535986	0.0089325425136872	0.0270576086412956	0.0020204049364899042	0.01618175681789528
+TG>AC	0.0001780000483032	0.0001605071470601	7.5158288658397e-05	0.0001011106827029	0.001390361298228	0.0091390999400486	0.0035741875467631	0.003762474112325	0.0064385133560384	0.0001307827123117	0.0007144486716497	0.000498733879958	0.0041402756627457	3.94025526246977e-05	0.000143361118697	0.0008162489138456	0.0021117254514069	0.0039584328920231	0.0018685550110523	0.0045823802698317	0.0015749729948250678	0.004133035625865314
+TG>AT	0.0018100448428269	0.0031298831675842	0.0008951651316682	5.99539849830627e-18	0.019426960070478	0.199974357411292	0.0017598103677979	0.0080331264523623	0.0006606783676183	0.0015795009169277	0.0086624833644248	0.0105939375198144	0.0173337616865026	0.0014420285415713	0.0016798990228994	0.0091438948063958	0.008280906484957	0.0236431722641545	0.0151595539507458	0.0579251928670582	0.01890110858867429	0.008725245589750559
+TG>CA	0.0002095446362948	0.000105058666517	0.0148571269111895	0.0006889235330708	0.0004532953508507	0.0103154196895269	0.0326042292341299	0.004944966227585	0.02019231173049	0.0184485735906008	0.0462824115192395	0.0084491173227891	0.0268039248727448	0.0084001465699368	0.0710439347693217	0.0055707011562865	0.132399957672905	0.0137958503235248	0.0068126122148075	0.002891305670661	0.08062003450758103	0.004588290660914599
+TG>CC	7.73586137538818e-05	4.3327673339653e-05	0.0004522547191514	0.0001028245101879	0.0004818648817668	0.0071393557326687	0.0014324040416558	0.001221582973764	0.0104504065363599	0.0001200419382777	0.0025822454008952	0.0123403655102771	0.0048731047901265	0.000614471469318	0.0001752139368303	0.0024762008347083	0.0157309103092346	0.0033160038822697	0.0018192891846165	0.0001554912984693	0.004103491405524545	0.0038565288012938456
+TG>CT	0.0013894530894448	0.0022398000023637	0.0056718716678581	7.03174595301349e-05	0.0003123553157924	0.248836870777822	1.23376512668992e-17	0.0190566869608553	0.0008572875720349	0.0027356961845125	0.0046034915742647	0.0098923664849445	0.0154478709919377	0.0006049227284176	0.0033157128657098	0.0100603813015805	0.0033980299920761	0.0092703777089654	0.0163313664844734	0.0143732565490152	0.0033445048625948964	0.02962634709455633
+TG>GA	0.0003056793793318	0.0010724773521161	0.0004886971411049	0.0067264277150307	0.0031140274412692	0.0067321686490035	0.0112545979202704	0.0002648394421094	0.0054731795795865	1.27618160983204e-05	0.0060307388082111	0.001243917362462	0.0057141677501302	0.0050187045451657	0.0049255349675745	0.0012146878078277	0.0090656636545491	0.0006761155620419	0.003189626903635	0.0227107184725166	0.009084732429609225	0.00180042513625433
+TG>GC	6.67518952761448e-05	0.0001984451204282	0.0004653363745182	0.0005175493494242	0.0002780724501218	0.0050672236753933	0.0052930721237933	0.0034595214253388	0.0034628047065375	4.68143847963139e-18	0.0050489905725683	0.0010563962967865	0.0020538361627074	0.0043175857287395	0.0005857841065357	0.001436236311468	0.0068011633059533	0.0007284688440936	0.0013258654976116	0.0006156919406063	0.0024075145223212786	0.0016013712037196252
+TG>GT	0.0014270060988761	0.0046692898715682	0.009624428307116	2.76644816421846e-05	0.0787553729234342	0.0247932013607457	0.0118821271669708	0.0076813106810528	0.0029579964038699	0.0013710069576271	0.0043229919605018	0.0030090172875602	0.0179347632243724	0.046233671123465	0.0052119759598007	0.0296130076541329	0.0029452516379464	0.0027193873913706	0.0092834645136071	0.0062298859984582	0.15567434321026838	0.014791048148842066
+TT>AA	0.0026217728870504	0.0019993947424273	0.0019131283515925	9.80263844529267e-06	0.0029791356056075	0.0001110424060397	0.203842323723009	0.0022245710515343	0.0001920244653033	0.0058250329805552	0.0025021997870849	0.0014773098744486	0.0078470348279849	0.174726069960353	0.0047358740030395	0.0217736987198324	0.0001225340325473	0.0151801176082712	0.0326705854814982	0.0472489179046698	0.023209177044225683	0.004595631280484825
+TT>AC	0.0003438390280203	0.0001600443576564	0.0014437583947452	3.59430076327398e-07	0.0005849280284008	7.36445942470915e-05	0.0346965657770139	7.02418845649252e-18	0.0037503853321759	2.9766637959345e-18	0.0005455529197237	0.0001415075433077	0.0008763175891521	0.0111945053804751	0.0021342451935003	0.0056231056309508	0.0069274502278064	0.00973698859413	0.0059449360055956	0.0079523136469714	0.00045655862466475555	0.0008908687701221847
+TT>AG	0.0001996175425544	9.97380233648983e-05	0.0136057872288079	3.8121371731693696e-18	0.0005407253651315	0.0012197430861788	0.0467536220504272	0.0090722733542047	0.0005169451803281	0.0027960160556235	0.0006662038898282	0.0010518114515806	0.0034470705709979	0.0061287669409654	0.000151157811241	0.0199043728809202	0.0037031168901796	0.0044845900034628	0.0058140030038719	0.0117334033634077	0.0013094046939795632	0.001147844211622285
+TT>CA	0.0003462266697435	1.93403996089965e-18	0.0004123323181223	3.8121371731693696e-18	6.3584399310592096e-18	4.77438456146641e-18	0.0847463614287331	0.0039085338302443	5.0866736534071e-18	0.0005182271241468	0.0010596315820975	0.0011354437612503	0.0022665267756888	0.0067300436030526	0.0015301320912206	0.0581284996775454	0.0080385290313224	0.0094587288780111	0.0136262916279354	0.0004830606550452	0.00019518635333510843	0.002130885450291116
+TT>CC	0.0025883439931944	1.382119684288e-06	0.0048481755160376	3.8121371731693696e-18	0.0004680635358622	4.77438456146641e-18	0.0307064606172004	0.0001826879527806	0.0029057040221031	0.0011569721747997	0.0020982805008303	6.47543500128086e-08	6.24882660398179e-07	0.337323787578476	0.0078642819728436	1.24735803881441e-06	2.19798211740599e-06	1.18172850615315e-07	0.0209932830386401	0.0020775815644555	0.00476964015715406	0.0012714828484742524
+TT>CG	4.00088735059047e-05	7.04973798697234e-06	0.0188936256972552	3.9482849293539896e-18	6.3584399310592096e-18	6.44254302270166e-06	0.0023159955135227	7.20812273651696e-05	1.11535036918561e-05	0.0034468127784143	5.2250750584403e-18	0.0005761280630147	0.0005098810409575	3.02809366051993e-05	0.0015460804542736	0.0072455572253496	0.0036864209023325	0.0021323031126352	0.0022893072755882	0.0007432230205083	0.0007857319924372998	0.00031672128679697664
+TT>GA	0.000888250941744	2.22159506299984e-05	0.0073079117982595	3.8121371731693696e-18	1.81064146608258e-05	4.77438456146641e-18	0.0378192569225705	0.0022556403424575	5.16553681082426e-18	0.0034910027785319	0.0003708712111159	0.0001523666411421	0.0016823251667352	0.0143204434161822	0.0004568872145082	0.0052861617413848	0.0050106270418628	0.0007565314412571	0.0101511850894796	0.0010163471315075	0.027915552253987567	0.0015987309988497848
+TT>GC	0.0005062072589884	7.14249769732724e-07	0.039510254679946	3.8121371731693696e-18	3.42750190569478e-05	2.3526786573973e-07	0.0031834095277796	0.000177716940826	2.00537743146503e-05	0.0103645416795188	3.03222227286998e-06	0.002251979252297	0.0004493840676621	0.0057560140186655	0.0060079985493143	0.0086194961184779	0.0105123451793032	0.0015056336006604	0.0059698757426146	0.0020437483170906	6.996225070471929e-05	0.0004944643964023177
+TT>GG	0.0007688621715247	1.93403996089965e-18	0.101597798257909	3.8121371731693696e-18	6.3584399310592096e-18	4.77438456146641e-18	7.844819495723869e-18	0.0003343072362475	5.08104057073444e-18	0.0340262281846757	3.85060752298713e-18	1.01264781403009e-07	1.38069311630836e-06	0.15859059531502	8.19628361752178e-06	0.0001780200807707	2.74747764675748e-06	2.20737966243702e-07	0.006541583082655	0.0001424133146828	1.182947595970371e-07	0.00048685703846710867

sigprofilerassignment-1.1.1/SigProfilerAssignment/data/Reference_Signatures/GRCh37/COSMIC_v3.5_RNA-SBS_GRCh37.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,193 @@
+Type	RNA-SBS1	RNA-SBS2	RNA-SBS3	RNA-SBS4	RNA-SBS5
+A[A>C]A	2.45e-05	4.43e-06	0.000104453	3.73e-05	7.89e-05
+A[A>C]C	1.33e-05	0.000573739	0.000126781	9.63e-05	2.59e-05
+A[A>C]G	3.81e-05	1.61e-05	0.000101784	1.11e-05	2.51e-05
+A[A>C]T	9.66e-06	3.12e-05	9.85e-05	9.5e-05	2.59e-05
+A[A>G]A	0.035655038	0.00459517	0.002278284	0.004228159	0.002160039
+A[A>G]C	0.020430637	0.001558437	0.007528176	0.004982356	0.003907447
+A[A>G]G	0.200239365	0.006177756	0.044365907	0.027787904	0.003516403
+A[A>G]T	0.018176868	0.009764373	0.030222184	0.013941911	0.004714295
+A[A>T]A	0.000249681	0.000237068	0.000313113	0.000403065	0.001853385
+A[A>T]C	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+A[A>T]G	2.86e-05	7.04e-05	0.000123001	0.000166038	0.001380928
+A[A>T]T	3.08e-05	1.06e-05	2.87e-05	0.000304792	0.000143533
+A[C>A]A	5.22e-05	4.66e-05	0.00016431	0.000708538	6.27e-05
+A[C>A]C	4.44e-05	4.28e-05	0.000603583	0.000146171	0.00015814
+A[C>A]G	0.00042305	0.000547818	0.000421331	0.002992639	0.001159979
+A[C>A]T	6.05e-05	3.94e-05	0.000105004	0.000183899	1.66e-05
+A[C>G]A	0.000113286	0.000348604	0.000171162	0.000344617	0.000970792
+A[C>G]C	1.74e-05	1.68e-05	0.000231858	0.00016	2.77e-05
+A[C>G]G	4.53e-05	3.54e-05	0.000152459	0.000189583	0.000148337
+A[C>G]T	0.00071653	0.000391938	0.001795521	0.004369812	0.001524729
+A[C>T]A	0.000889186	0.001663523	0.000591687	0.006349582	0.001756504
+A[C>T]C	0.00021872	0.001070496	0.000915874	0.001060707	0.00152265
+A[C>T]G	0.00049247	0.00262585	0.00151464	0.020023407	0.000776926
+A[C>T]T	0.006344512	0.003313879	0.008595561	0.006210768	0.003076971
+A[G>A]A	0.00039795	0.001163179	0.00135848	0.006027823	0.00153246
+A[G>A]C	0.001918092	0.001466698	0.000805134	0.030021359	0.00141005
+A[G>A]G	0.000337505	0.000368956	0.002223804	0.010549629	0.000266609
+A[G>A]T	0.000400713	0.000246816	0.001757531	0.000549296	0.000691759
+A[G>C]A	0.000131848	0.000682447	0.003520395	0.001087747	0.00017289
+A[G>C]C	8.54e-05	7.18e-05	0.000234339	0.000561065	0.000614832
+A[G>C]G	0.000949045	0.001340975	0.00401604	0.000468663	0.005052531
+A[G>C]T	0.000183032	0.001397152	0.000288661	0.001320991	0.00045734
+A[G>T]A	0.00023855	0.00076881	0.002653424	0.001090008	0.157692715
+A[G>T]C	0.001259368	0.000240056	0.001545661	0.000993084	0.124848978
+A[G>T]G	3.38e-05	0.000168065	0.000168467	0.000220992	0.009954801
+A[G>T]T	0.000200196	0.00033525	0.000623328	0.000538754	0.054561997
+A[T>A]A	3.46e-05	0.000252078	0.000242974	0.000150166	0.000531813
+A[T>A]C	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+A[T>A]G	4.44e-05	0.001227168	5.45e-05	0.000283125	0.000138842
+A[T>A]T	6.75e-05	2.12e-05	0.000163466	9.95e-05	4.24e-05
+A[T>C]A	0.000450631	0.000201366	0.000335248	0.007126633	0.001417057
+A[T>C]C	0.00349237	0.004153045	0.029144874	0.001589718	0.002189608
+A[T>C]G	0.002418677	0.005420251	0.012587775	0.021034791	0.003111779
+A[T>C]T	0.000314361	0.000529604	0.000315955	0.005461917	0.001136433
+A[T>G]A	4.36e-05	0.000239517	0.000128246	0.000368611	4.42e-05
+A[T>G]C	8.67e-06	9.39e-05	6.78e-06	0.000107542	0.000189978
+A[T>G]G	0.003687309	0.003461749	0.004474658	0.014188697	0.002146296
+A[T>G]T	0.004401209	0.00320736	0.008341329	0.011054562	0.004278513
+C[A>C]A	8.71e-05	0.001022148	0.000190041	0.000604962	0.000513119
+C[A>C]C	0.000279614	0.000220708	0.000592851	0.000137162	0.000192449
+C[A>C]G	0.000487004	0.000471749	0.000903229	0.002968029	0.000534629
+C[A>C]T	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+C[A>G]A	0.004278463	0.002570686	0.003683561	0.008453454	0.000836547
+C[A>G]C	0.009007546	0.001127766	0.000639903	0.004626155	0.001139662
+C[A>G]G	0.158760057	0.005796538	0.109338631	0.004350134	0.012149129
+C[A>G]T	0.00582586	0.001036424	0.000978789	0.002326395	0.001217894
+C[A>T]A	9.52e-06	1.08e-05	0.000114663	8.82e-05	1.21e-05
+C[A>T]C	3.93e-05	0.00105942	8.14e-05	0.001015742	0.000203318
+C[A>T]G	2.76e-05	0.000613388	0.000384594	0.000478036	7.52e-05
+C[A>T]T	2.51e-05	0.000631415	0.000180743	0.000227668	3.61e-05
+C[C>A]A	0.000111089	0.000407848	8.59e-05	0.000669255	0.00039743
+C[C>A]C	0.000288764	0.001525597	0.001034679	0.001209495	0.001805053
+C[C>A]G	5.98e-05	0.000715641	0.000256755	0.000104861	0.000676098
+C[C>A]T	0.002203069	0.000649678	0.001112422	0.003547424	0.002584957
+C[C>G]A	0.000137311	8.95e-05	0.000110442	0.000177082	3.52e-05
+C[C>G]C	2.37e-06	3.83e-06	2.96e-06	4.45e-05	0.000793026
+C[C>G]G	7.58e-05	9.21e-07	1.28e-05	1.08e-05	5.44e-06
+C[C>G]T	6.41e-05	0.001177182	0.000761044	0.000261606	0.000469205
+C[C>T]A	0.0017927	0.022062203	0.00189597	0.006665567	0.00015186
+C[C>T]C	0.001127692	0.006424574	0.00599526	0.013368988	0.001129106
+C[C>T]G	0.003410492	0.06775126	0.013537632	0.010863377	0.001570593
+C[C>T]T	0.001588728	0.001283112	0.009097968	0.004015721	0.002705576
+C[G>A]A	0.000400546	0.002656826	0.000730179	0.006274138	0.001796833
+C[G>A]C	0.001392078	0.009434764	0.009489025	0.060222341	0.002178721
+C[G>A]G	0.001611987	0.001730058	0.005911797	0.020125249	0.004459314
+C[G>A]T	0.000258479	0.003115038	0.00151481	0.004700416	0.004517689
+C[G>C]A	0.000238468	0.000304698	0.000733376	0.000553568	0.000189199
+C[G>C]C	3.34e-05	8.82e-06	0.000167474	1.81e-05	0.00079469
+C[G>C]G	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+C[G>C]T	7.04e-06	2.97e-05	4.08e-05	0.000103769	0.000282861
+C[G>T]A	0.000176154	0.000320178	0.001438815	0.000202572	0.01259361
+C[G>T]C	4.9e-05	0.000202384	0.000524543	0.000182974	0.013374099
+C[G>T]G	4.52e-05	0.000532014	7.73e-05	0.000154494	0.0026532
+C[G>T]T	0.000106014	0.000949711	0.000705589	0.00030539	0.023458579
+C[T>A]A	2.11e-05	0.000166418	0.000238634	0.000178426	0.000742759
+C[T>A]C	8.18e-05	0.000265633	0.000302205	0.00352901	8.6e-05
+C[T>A]G	8.5e-05	0.000698691	0.000355013	0.001043241	9.61e-05
+C[T>A]T	1.25e-05	6.37e-05	6.55e-05	7.2e-05	0.001210745
+C[T>C]A	0.003124838	0.000698315	0.007432585	0.031958787	0.010684695
+C[T>C]C	0.020945104	0.010046395	0.166901844	0.001608182	0.015982026
+C[T>C]G	0.000460244	0.000448443	0.001244128	0.013617495	0.00099194
+C[T>C]T	0.001476514	0.000605017	0.000654749	0.014211653	0.000941367
+C[T>G]A	4.57e-05	7.32e-05	1.79e-05	0.000513345	0.000120179
+C[T>G]C	1.35e-05	3.02e-05	1.22e-05	0.000183647	4.05e-06
+C[T>G]G	0.000199758	0.001117252	0.001313716	0.00203527	0.000405663
+C[T>G]T	1.66e-05	0.000141361	0.000143116	0.000424305	0.000144796
+G[A>C]A	3.58e-05	0.000214794	3.14e-05	0.000267814	2.73e-05
+G[A>C]C	7.46e-05	1.5e-05	0.000114981	8.12e-05	0.000226254
+G[A>C]G	6.33e-05	7.03e-06	0.000117693	0.000106348	0.000259035
+G[A>C]T	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+G[A>G]A	0.003506687	0.001952251	0.001287393	0.007465351	0.006251202
+G[A>G]C	0.000114872	0.001127641	0.000165371	0.004742643	0.000186837
+G[A>G]G	0.008511646	0.001386293	0.001997087	0.002678322	0.00105556
+G[A>G]T	6.53e-05	6.68e-05	3.83e-05	0.000997113	0.000884294
+G[A>T]A	3.14e-05	0.00050067	0.000131266	0.000214386	0.000439456
+G[A>T]C	1.78e-05	9.58e-05	0.000164848	0.000210641	6.99e-05
+G[A>T]G	5.16e-05	0.000158307	0.000235141	0.000464665	0.001403368
+G[A>T]T	0.000153835	7.12e-05	0.000544698	0.000526892	0.00151971
+G[C>A]A	0.000146469	0.000223704	0.000144486	0.000300626	5.34e-05
+G[C>A]C	6.96e-05	0.001181086	0.000736535	0.000617154	0.000689264
+G[C>A]G	2.59e-05	3.04e-06	2.14e-05	0.000143741	1.24e-05
+G[C>A]T	7.23e-05	1.5e-05	0.000267842	0.000197374	0.000120744
+G[C>G]A	4.18e-05	0.000186271	8.64e-05	0.000250806	0.002912286
+G[C>G]C	0.000154819	0.000139638	0.000192835	0.003695866	0.000253486
+G[C>G]G	2.28e-05	6.3e-05	0.000203192	0.000177263	2.35e-05
+G[C>G]T	3.38e-05	1.31e-05	5.52e-05	3.7e-05	7.06e-05
+G[C>T]A	0.000189475	0.000248944	0.000517753	0.008266511	0.000253562
+G[C>T]C	0.003042141	0.005193176	0.007193612	0.002931767	0.005318983
+G[C>T]G	0.000360856	0.004164819	0.002153831	0.005582074	0.000705919
+G[C>T]T	0.007543922	0.010753901	0.019350401	0.007075996	0.00314325
+G[G>A]A	0.001641663	0.004560194	0.012809929	0.025678202	0.00108032
+G[G>A]C	0.00636525	0.00419589	0.032044464	0.15623687	0.002057781
+G[G>A]G	0.001846434	0.004610407	0.024304324	0.042380449	0.002612261
+G[G>A]T	0.000615488	0.001518742	0.000533474	0.007509337	0.000686889
+G[G>C]A	0.000163073	0.000525126	0.000592846	0.000258682	0.00099965
+G[G>C]C	0.000202947	0.000271978	0.001132293	0.000910118	0.000315798
+G[G>C]G	0.000115503	0.000666272	0.000754142	6.64e-05	4.56e-05
+G[G>C]T	0.000154685	0.000726461	0.000189731	0.000550599	2.81e-05
+G[G>T]A	0.000227049	0.001956359	0.002695809	0.000588462	0.082964921
+G[G>T]C	0.000260856	0.002610431	0.000396968	0.001787799	0.053276618
+G[G>T]G	0.000380952	0.000448289	0.000341247	0.000230026	0.003442747
+G[G>T]T	0.000423874	0.000487338	0.001111234	0.005434713	0.047741091
+G[T>A]A	1.87e-05	2.14e-05	0.000142737	0.000249102	0.000128113
+G[T>A]C	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+G[T>A]G	0.000205415	0.000253011	0.00015443	0.000857465	5.87e-05
+G[T>A]T	3.53e-05	2.99e-05	0.000100799	1.59e-05	1.09e-05
+G[T>C]A	0.001799354	0.004404187	0.001492834	0.024388074	0.000284319
+G[T>C]C	0.006628743	0.005112013	0.11845918	0.001341045	0.005616545
+G[T>C]G	0.000372989	0.003556632	0.001396012	0.005510532	0.001808536
+G[T>C]T	0.000998201	0.00154723	0.000346257	0.007883105	0.001003426
+G[T>G]A	0.000191271	2.4e-05	0.000107628	0.000788785	4.75e-05
+G[T>G]C	0.000883235	0.000807968	0.01329146	0.006068571	0.001585366
+G[T>G]G	0.000205133	2.21e-05	0.00046754	0.000384117	0.000934158
+G[T>G]T	1.44e-05	2.76e-05	0.00011502	0.000218191	0.000292173
+T[A>C]A	4.19e-05	3.59e-05	0.000113151	0.000567828	3.45e-05
+T[A>C]C	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+T[A>C]G	1.44e-05	0.000491729	1.57e-05	2.83e-06	1.32e-06
+T[A>C]T	0.000144632	7.58e-05	0.000463271	0.00026053	4.67e-05
+T[A>G]A	0.046342841	0.002627361	0.001929608	0.009773484	0.001263526
+T[A>G]C	0.06486876	0.008978333	0.018668516	0.011845272	0.02511718
+T[A>G]G	0.227248867	0.008164532	0.05023747	0.004203506	0.007609408
+T[A>G]T	0.064710563	0.007909384	0.046352976	0.033356989	0.019021362
+T[A>T]A	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
+T[A>T]C	8.02e-06	3.98e-05	6.21e-05	1.57e-05	0.000602611
+T[A>T]G	3.82e-05	2.63e-05	0.000112815	0.000237733	3.39e-05
+T[A>T]T	6.74e-05	0.000431121	0.00018292	0.000571801	0.000176202
+T[C>A]A	1.59e-05	4.93e-05	5.73e-05	0.000122033	1.85e-05
+T[C>A]C	2.54e-05	0.000124866	0.000240663	0.000373705	2.87e-05
+T[C>A]G	2.32e-05	6.44e-05	0.000130759	9.13e-06	1.7e-05
+T[C>A]T	3.02e-05	0.000141803	9.78e-05	0.000438507	0.000210958
+T[C>G]A	0.000312318	0.002439391	0.001492376	0.000863647	0.000755062
+T[C>G]C	0.000160765	0.00088707	0.000908084	0.000853459	0.001410344
+T[C>G]G	3.15e-05	0.00126159	0.000223281	3.83e-05	0.000578127
+T[C>G]T	0.00017969	0.001066732	0.002109545	0.001188212	0.000851639
+T[C>T]A	0.000858041	0.156741393	0.006281905	0.00307376	0.002832419
+T[C>T]C	0.000831515	0.022272507	0.006168146	0.001043228	0.001901997
+T[C>T]G	0.002071684	0.454563596	0.006341893	0.003316044	0.003628483
+T[C>T]T	0.000872614	0.02844217	0.006605288	0.004691776	0.001518834
+T[G>A]A	0.000512063	0.003343217	0.002062876	0.006912131	0.000854079
+T[G>A]C	0.007725382	0.008253539	0.028324372	0.08105224	0.004618234
+T[G>A]G	0.001447834	0.001023245	0.0083496	0.026015314	0.003948633
+T[G>A]T	0.000197636	0.001081579	0.001929274	0.001702919	0.000621816
+T[G>C]A	0.000158428	0.000583622	0.002031503	0.000749731	0.000268061
+T[G>C]C	6.41e-05	0.000130731	0.000183462	0.002423554	0.000702158
+T[G>C]G	0.000207597	0.0021182	0.001660823	0.00043486	0.000683418
+T[G>C]T	2.29e-05	0.000141645	0.00016051	8.37e-05	0.001510415
+T[G>T]A	0.00016792	0.001497556	0.00201431	0.00027712	0.050083968
+T[G>T]C	0.002237088	0.000572055	0.001789283	0.001450028	0.018253365
+T[G>T]G	0.000363793	0.000555592	0.000626471	0.000514411	0.02248655
+T[G>T]T	0.000357641	0.000542021	0.000229658	0.000301772	0.058133155
+T[T>A]A	1.05e-05	0.000138966	0.000116689	2.51e-05	9.56e-06
+T[T>A]C	2.44e-05	6.58e-05	0.000129091	6.33e-06	1.84e-05
+T[T>A]G	5.92e-05	5.68e-05	4.09e-05	0.000961178	9.77e-05
+T[T>A]T	0.000330943	7.07e-05	0.000211874	0.001004065	4.07e-05
+T[T>C]A	0.000333578	0.001470296	0.000345825	0.006828137	0.000979222
+T[T>C]C	0.001376909	0.003415676	0.013148824	0.002883195	0.002913756
+T[T>C]G	0.000859625	0.001005976	0.011938407	0.01068374	0.002150558
+T[T>C]T	0.000378147	4.66e-05	0.000337351	0.00189514	0.002328149
+T[T>G]A	0.000116124	0.00024882	7.47e-05	0.000724919	2.89e-05
+T[T>G]C	0.000132377	0.000102869	0.000138335	0.001719365	3.41e-05
+T[T>G]G	3.31e-05	3.55e-06	7.6e-05	1.41e-05	0.000213908
+T[T>G]T	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

SigProfilerAssignment 1.1.0__tar.gz → 1.1.1__tar.gz

SigProfilerAssignment 1.1.0tar.gz → 1.1.1tar.gz