MDANSE-GUI 0.1.0a1__tar.gz

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  2. MDANSE_GUI-0.1.0a1/LICENSE +675 -0
  3. MDANSE_GUI-0.1.0a1/MANIFEST.in +6 -0
  4. MDANSE_GUI-0.1.0a1/PKG-INFO +808 -0
  5. MDANSE_GUI-0.1.0a1/README.md +101 -0
  6. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/BackEnd.py +108 -0
  7. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/DataViewModel/ActionsHolder.py +135 -0
  8. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/DataViewModel/JobHolder.py +175 -0
  9. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/DataViewModel/JobStatusQt.py +65 -0
  10. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/DataViewModel/TrajectoryHolder.py +143 -0
  11. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/DataViewModel/__init__.py +15 -0
  12. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/ElementsDatabaseEditor.py +254 -0
  13. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Icons/__init__.py +34 -0
  14. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Icons/about.png +0 -0
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  49. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/AtomSelectionWidget.py +363 -0
  50. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/AtomTransmutationWidget.py +64 -0
  51. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/BackupWidget.py +48 -0
  52. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/BooleanWidget.py +57 -0
  53. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/ComboWidget.py +64 -0
  54. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/DummyWidget.py +54 -0
  55. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/FloatWidget.py +83 -0
  56. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/FramesWidget.py +99 -0
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  58. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/InputDirectoryWidget.py +28 -0
  59. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/InputFileWidget.py +95 -0
  60. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/InstrumentResolutionWidget.py +145 -0
  61. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/IntegerWidget.py +79 -0
  62. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/InterpolationOrderWidget.py +81 -0
  63. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/MoleculeWidget.py +72 -0
  64. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/MultipleCombosWidget.py +70 -0
  65. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/OutputDirectoryWidget.py +29 -0
  66. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/OutputFilesWidget.py +173 -0
  67. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/OutputTrajectoryWidget.py +135 -0
  68. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/ProjectionWidget.py +83 -0
  69. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/QVectorsWidget.py +122 -0
  70. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/RangeWidget.py +100 -0
  71. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/RunningModeWidget.py +83 -0
  72. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/StringWidget.py +67 -0
  73. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/VectorWidget.py +51 -0
  74. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/WidgetBase.py +145 -0
  75. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/InputWidgets/__init__.py +41 -0
  76. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/AtomProperties.py +201 -0
  77. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/ColourManager.py +93 -0
  78. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/Contents.py +72 -0
  79. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/Controls.py +333 -0
  80. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/Dummy.py +38 -0
  81. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/MolecularViewer.py +767 -0
  82. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/__init__.py +15 -0
  83. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/database/__init__.py +36 -0
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  85. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/database/residues.yml +33 -0
  86. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/readers/__init__.py +46 -0
  87. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/readers/hdf5wrapper.py +48 -0
  88. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/readers/i_reader.py +266 -0
  89. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/MolecularViewer/readers/reader_registry.py +25 -0
  90. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/PeriodicTableViewer.py +426 -0
  91. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/__init__.py +15 -0
  92. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/__init__.py +15 -0
  93. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/about_dialog.py +88 -0
  94. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/cross_viewer_dialog.py +539 -0
  95. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/data_viewer_1d_dialog.py +139 -0
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  97. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/inspect_data_dialog.py +449 -0
  98. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/plot_1d_axis_settings_dialog.py +268 -0
  99. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/plot_1d_general_settings_dialog.py +262 -0
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  105. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/plot_nd_image_settings_dialog.py +122 -0
  106. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/slice_viewer_dialog.py +465 -0
  107. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/units_editor_dialog.py +193 -0
  108. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/dialogs/viewer_1d_dialog.py +33 -0
  109. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/handlers/__init__.py +15 -0
  110. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/handlers/logger_popup.py +33 -0
  111. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/handlers/logger_widget.py +65 -0
  112. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/models/__init__.py +15 -0
  113. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/models/data_list_model.py +101 -0
  114. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/models/data_tree_model.py +598 -0
  115. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/models/plot_1d_model.py +941 -0
  116. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/models/plot_2d_model.py +435 -0
  117. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/models/plot_nd_model.py +1043 -0
  118. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/utils/__init__.py +15 -0
  119. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/utils/numeric.py +781 -0
  120. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/utils/sorted_dict.py +804 -0
  121. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/utils/sorted_list.py +2604 -0
  122. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/utils/sorted_set.py +724 -0
  123. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/views/__init__.py +15 -0
  124. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/views/table_views.py +24 -0
  125. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/__init__.py +15 -0
  126. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/actions_widget.py +97 -0
  127. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/data_widget.py +158 -0
  128. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/datasets_widget.py +90 -0
  129. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/logger_widget.py +58 -0
  130. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/main_window.py +267 -0
  131. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/plot_1d_widget.py +243 -0
  132. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/plot_2d_widget.py +139 -0
  133. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/plot_actions_widget.py +68 -0
  134. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/plot_nd_widget.py +204 -0
  135. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/preview_widget.py +53 -0
  136. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Plotter/widgets/range_slider.py +277 -0
  137. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/RegistryViewer.py +304 -0
  138. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Resources.py +49 -0
  139. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Scripts/__init__.py +15 -0
  140. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Scripts/mdanse_elements_database.py +32 -0
  141. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Scripts/mdanse_gui.py +27 -0
  142. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Scripts/mdanse_periodic_table.py +29 -0
  143. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Scripts/mdanse_plotter.py +30 -0
  144. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Scripts/mdanse_units_editor.py +29 -0
  145. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Session/LocalSession.py +58 -0
  146. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Session/Logger.py +52 -0
  147. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Session/__init__.py +15 -0
  148. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/SubclassViewer.py +134 -0
  149. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Subprocess/JobState.py +242 -0
  150. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Subprocess/JobStatusProcess.py +86 -0
  151. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Subprocess/Subprocess.py +47 -0
  152. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Subprocess/__init__.py +15 -0
  153. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/TabbedWindow.py +291 -0
  154. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/ConverterTab.py +139 -0
  155. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/GeneralTab.py +97 -0
  156. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/JobTab.py +168 -0
  157. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Layouts/DoublePanel.py +141 -0
  158. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Layouts/SinglePanel.py +110 -0
  159. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Layouts/TriplePanel.py +30 -0
  160. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Layouts/__init__.py +15 -0
  161. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/LoggingTab.py +94 -0
  162. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Models/GeneralModel.py +73 -0
  163. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Models/JobHolder.py +247 -0
  164. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Models/JobTree.py +123 -0
  165. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Models/__init__.py +15 -0
  166. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/RunTab.py +109 -0
  167. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Settings/LocalSettings.py +25 -0
  168. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Settings/__init__.py +15 -0
  169. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/TrajectoryTab.py +112 -0
  170. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Views/ActionsTree.py +124 -0
  171. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Views/RunTable.py +155 -0
  172. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Views/TrajectoryView.py +80 -0
  173. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Views/__init__.py +15 -0
  174. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Visualisers/Action.py +280 -0
  175. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Visualisers/AnalysisInfo.py +61 -0
  176. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Visualisers/TextInfo.py +47 -0
  177. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Visualisers/TrajectoryInfo.py +69 -0
  178. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Visualisers/View3D.py +50 -0
  179. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/Visualisers/__init__.py +15 -0
  180. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Tabs/__init__.py +15 -0
  181. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/UnitsEditor.py +208 -0
  182. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/ConvertDialog.py +118 -0
  183. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/ConvertWizard.py +483 -0
  184. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/GeneralWidgets.py +659 -0
  185. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/Generator.py +78 -0
  186. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/LoaderButton.py +70 -0
  187. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/Oscillator.py +76 -0
  188. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/StyleDialog.py +153 -0
  189. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/TrajectoryViewer.py +70 -0
  190. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/Widgets/__init__.py +14 -0
  191. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/__init__.py +26 -0
  192. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI/main.py +57 -0
  193. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI.egg-info/PKG-INFO +808 -0
  194. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI.egg-info/SOURCES.txt +204 -0
  195. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI.egg-info/dependency_links.txt +1 -0
  196. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI.egg-info/entry_points.txt +7 -0
  197. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI.egg-info/requires.txt +6 -0
  198. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Src/MDANSE_GUI.egg-info/top_level.txt +1 -0
  199. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Tests/UnitTests/test_ColourManager.py +40 -0
  200. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Tests/UnitTests/test_FileObject.py +23 -0
  201. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Tests/UnitTests/test_GeneralModel.py +35 -0
  202. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Tests/UnitTests/test_JobState.py +17 -0
  203. MDANSE_GUI-0.1.0a1/Tests/UnitTests/test_hdf5wrapper.py +113 -0
  204. MDANSE_GUI-0.1.0a1/pyproject.toml +59 -0
  205. MDANSE_GUI-0.1.0a1/setup.cfg +4 -0
  206. MDANSE_GUI-0.1.0a1/setup.py +216 -0
MDANSE_GUI-0.1.0a1/AUTHORS ADDED
@@ -0,0 +1,18 @@
1
+ MDANSE project has been created by:
2
+
3
+ * Eric Pellegrini
4
+
5
+ MDANSE source code is currently developed by
6
+
7
+ * Eric Pellegrini
8
+ * Maciej Bartkowiak
9
+ * Chi Cheng
10
+ * Sanghamitra Mukhopadhyay
11
+
12
+ MDANSE former contributors:
13
+
14
+ * Bachir Aoun
15
+ * Gael Goret
16
+ * Remi Perenon
17
+ * Rastislav Turanyi
18
+