rbbt-util 5.26.161 → 5.26.162

checksums.yaml

@@ -1,7 +1,7 @@
 ---
-SHA1:
-  metadata.gz: 57bfa7452ba83b447abdb1879fe9ec9be7018c30
-  data.tar.gz: d8cd308c151efc36accc224ba7ccf15cc5472919
+SHA256:
+  metadata.gz: f2c2ede8d746f69d82b953d794c101536c975e7bafbd84d5c8265ea827f71fed
+  data.tar.gz: 70d9262d64a126c30bb987c251c1000bdc762d7a74180da148c2d550bfb3557a
 SHA512:
-  metadata.gz: 5de4208abae99508dd8731d2889ea905a3de2edf1e88a5df8c91d5d773ab4b230eee2ce287ddf06b61ac7a1166423cf46ac57bb3f4d1c457a0e0c66ec798abbe
-  data.tar.gz: 526d67aa0673fd488f3ec0f9a42b2327845ca2c16ec410749c3f97c0d183e97811c276822c3873ca74d47224009dc8d826b1995fb44ce0334954724d9b1d76f5
+  metadata.gz: 57ce06e0635fd13a5906e945df884c05e864aec59bd729ac191e80cd1f8628b68a780efe5b8e9e9a4964becc5b18be21ad1044b3f7e0df864d04284dbcd4555f
+  data.tar.gz: 6af68737fb7b4932f4f2d588806f786e62f49598824479374b4761ea9b27d93ea1b70f0b731bd9552c8f7b3a872b26c2aeb646dafd2afaacfa283b6b119b1d13

data/lib/rbbt/util/open.rb

@@ -778,6 +778,7 @@ module Open
 
           file = Pathname.new(file).realpath.to_s 
         end
+        return nil unless File.exists?(file)
         File.mtime(file)
       rescue
         Log.exception $!

metadata

@@ -1,7 +1,7 @@
 --- !ruby/object:Gem::Specification
 name: rbbt-util
 version: !ruby/object:Gem::Version
-  version: 5.26.161
+  version: 5.26.162
 platform: ruby
 authors:
 - Miguel Vazquez
@@ -533,95 +533,94 @@ required_rubygems_version: !ruby/object:Gem::Requirement
     - !ruby/object:Gem::Version
       version: '0'
 requirements: []
-rubyforge_project: 
-rubygems_version: 2.5.2.3
+rubygems_version: 3.0.6
 signing_key: 
 specification_version: 4
 summary: Utilities for the Ruby Bioinformatics Toolkit (rbbt)
 test_files:
-- test/rbbt/test_knowledge_base.rb
-- test/rbbt/association/test_item.rb
-- test/rbbt/association/test_index.rb
-- test/rbbt/association/test_open.rb
-- test/rbbt/association/test_util.rb
-- test/rbbt/association/test_database.rb
-- test/rbbt/test_association.rb
-- test/rbbt/util/misc/test_multipart_payload.rb
+- test/rbbt/test_entity.rb
+- test/rbbt/workflow/test_remote_workflow.rb
+- test/rbbt/workflow/test_doc.rb
+- test/rbbt/workflow/test_step.rb
+- test/rbbt/workflow/remote/test_client.rb
+- test/rbbt/workflow/step/test_dependencies.rb
+- test/rbbt/workflow/test_task.rb
+- test/rbbt/resource/test_path.rb
+- test/rbbt/util/test_colorize.rb
 - test/rbbt/util/misc/test_omics.rb
-- test/rbbt/util/misc/test_bgzf.rb
-- test/rbbt/util/misc/test_lock.rb
 - test/rbbt/util/misc/test_pipes.rb
-- test/rbbt/util/simpleopt/test_get.rb
-- test/rbbt/util/simpleopt/test_parse.rb
-- test/rbbt/util/simpleopt/test_setup.rb
-- test/rbbt/util/test_semaphore.rb
-- test/rbbt/util/test_config.rb
-- test/rbbt/util/test_R.rb
+- test/rbbt/util/misc/test_lock.rb
+- test/rbbt/util/misc/test_multipart_payload.rb
+- test/rbbt/util/misc/test_bgzf.rb
+- test/rbbt/util/test_concurrency.rb
+- test/rbbt/util/test_cmd.rb
+- test/rbbt/util/R/test_plot.rb
 - test/rbbt/util/R/test_eval.rb
 - test/rbbt/util/R/test_model.rb
-- test/rbbt/util/R/test_plot.rb
-- test/rbbt/util/test_excel2tsv.rb
-- test/rbbt/util/test_open.rb
-- test/rbbt/util/test_colorize.rb
-- test/rbbt/util/concurrency/processes/test_socket.rb
-- test/rbbt/util/concurrency/test_threads.rb
-- test/rbbt/util/concurrency/test_processes.rb
-- test/rbbt/util/test_cmd.rb
+- test/rbbt/util/test_config.rb
 - test/rbbt/util/test_log.rb
 - test/rbbt/util/test_simpleDSL.rb
 - test/rbbt/util/log/test_progress.rb
 - test/rbbt/util/test_tmpfile.rb
+- test/rbbt/util/test_R.rb
+- test/rbbt/util/test_excel2tsv.rb
 - test/rbbt/util/test_misc.rb
+- test/rbbt/util/test_open.rb
+- test/rbbt/util/test_simpleopt.rb
+- test/rbbt/util/simpleopt/test_parse.rb
+- test/rbbt/util/simpleopt/test_setup.rb
+- test/rbbt/util/simpleopt/test_get.rb
 - test/rbbt/util/test_python.rb
-- test/rbbt/util/test_chain_methods.rb
-- test/rbbt/util/test_concurrency.rb
 - test/rbbt/util/test_filecache.rb
-- test/rbbt/util/test_simpleopt.rb
-- test/rbbt/entity/test_identifiers.rb
-- test/rbbt/test_fix_width_table.rb
+- test/rbbt/util/concurrency/test_processes.rb
+- test/rbbt/util/concurrency/test_threads.rb
+- test/rbbt/util/concurrency/processes/test_socket.rb
+- test/rbbt/util/test_semaphore.rb
+- test/rbbt/util/test_chain_methods.rb
+- test/rbbt/test_resource.rb
+- test/rbbt/test_packed_index.rb
+- test/rbbt/tsv/test_change_id.rb
 - test/rbbt/tsv/test_attach.rb
-- test/rbbt/tsv/test_stream.rb
-- test/rbbt/tsv/test_excel.rb
-- test/rbbt/tsv/parallel/test_through.rb
-- test/rbbt/tsv/parallel/test_traverse.rb
-- test/rbbt/tsv/test_index.rb
-- test/rbbt/tsv/test_matrix.rb
-- test/rbbt/tsv/test_parallel.rb
-- test/rbbt/tsv/test_util.rb
+- test/rbbt/tsv/test_filter.rb
+- test/rbbt/tsv/test_parser.rb
 - test/rbbt/tsv/test_accessor.rb
+- test/rbbt/tsv/test_matrix.rb
 - test/rbbt/tsv/test_field_index.rb
+- test/rbbt/tsv/test_util.rb
+- test/rbbt/tsv/test_index.rb
+- test/rbbt/tsv/test_parallel.rb
 - test/rbbt/tsv/test_manipulate.rb
-- test/rbbt/tsv/test_change_id.rb
-- test/rbbt/tsv/test_filter.rb
-- test/rbbt/tsv/test_parser.rb
-- test/rbbt/test_workflow.rb
-- test/rbbt/test_packed_index.rb
+- test/rbbt/tsv/test_excel.rb
+- test/rbbt/tsv/parallel/test_through.rb
+- test/rbbt/tsv/parallel/test_traverse.rb
+- test/rbbt/tsv/test_stream.rb
+- test/rbbt/test_association.rb
+- test/rbbt/association/test_database.rb
+- test/rbbt/association/test_item.rb
+- test/rbbt/association/test_open.rb
+- test/rbbt/association/test_util.rb
+- test/rbbt/association/test_index.rb
+- test/rbbt/test_knowledge_base.rb
+- test/rbbt/persist/tsv/test_kyotocabinet.rb
+- test/rbbt/persist/tsv/test_cdb.rb
+- test/rbbt/persist/tsv/test_lmdb.rb
+- test/rbbt/persist/tsv/test_sharder.rb
+- test/rbbt/persist/tsv/test_leveldb.rb
+- test/rbbt/persist/tsv/test_tokyocabinet.rb
+- test/rbbt/persist/test_tsv.rb
+- test/rbbt/test_tsv.rb
 - test/rbbt/test_annotations.rb
-- test/rbbt/test_persist.rb
+- test/rbbt/test_fix_width_table.rb
+- test/rbbt/test_workflow.rb
+- test/rbbt/entity/test_identifiers.rb
 - test/rbbt/annotations/test_util.rb
-- test/rbbt/workflow/test_doc.rb
-- test/rbbt/workflow/test_remote_workflow.rb
-- test/rbbt/workflow/test_step.rb
-- test/rbbt/workflow/step/test_dependencies.rb
-- test/rbbt/workflow/test_task.rb
-- test/rbbt/workflow/remote/test_client.rb
+- test/rbbt/test_hpc.rb
+- test/rbbt/test_monitor.rb
+- test/rbbt/test_persist.rb
+- test/rbbt/knowledge_base/test_entity.rb
+- test/rbbt/knowledge_base/test_registry.rb
 - test/rbbt/knowledge_base/test_syndicate.rb
-- test/rbbt/knowledge_base/test_enrichment.rb
 - test/rbbt/knowledge_base/test_query.rb
+- test/rbbt/knowledge_base/test_enrichment.rb
 - test/rbbt/knowledge_base/test_traverse.rb
-- test/rbbt/knowledge_base/test_entity.rb
-- test/rbbt/knowledge_base/test_registry.rb
-- test/rbbt/test_resource.rb
-- test/rbbt/test_tsv.rb
-- test/rbbt/test_hpc.rb
-- test/rbbt/resource/test_path.rb
-- test/rbbt/test_entity.rb
-- test/rbbt/test_monitor.rb
-- test/rbbt/persist/tsv/test_tokyocabinet.rb
-- test/rbbt/persist/tsv/test_leveldb.rb
-- test/rbbt/persist/tsv/test_lmdb.rb
-- test/rbbt/persist/tsv/test_kyotocabinet.rb
-- test/rbbt/persist/tsv/test_cdb.rb
-- test/rbbt/persist/tsv/test_sharder.rb
-- test/rbbt/persist/test_tsv.rb
 - test/test_helper.rb